永曆十六年五月初八（清康熙元年、1662年6月23日）鄭成功病逝，虛齡三十九歲（未滿三十八周歲）。

在此之前，清順治十八年（南明永曆十五年、1661年11月24日)，清朝藉口與鄭成功勾結，處斬鄭成功父親鄭芝龍及其親族十一人。

鄭成功親征台灣時，安排長子鄭經（生於崇禎十五年、1642年10月）留守廈門（當時稱為思明州）。鄭經年少好色，與其弟鄭智之乳母陳昭娘私通，生下長子克臧，卻被正室唐氏指控「亂倫」，唐氏父親為鄭成功大將唐顯悅，向鄭成功告發，鄭成功勃然大怒，下令掌管廈門軍隊的堂兄鄭泰...