हर्माइनी तथा चीलघात की एक और मगलू छात्रा के ऊपर हमले होते हैं ।इसके बाद हॉगवर्ड्स में पूरी गतिविधियां रुक जाती हैं । सभी शिक्षक पहरेदारी पर लग जाते हैं। हैरी हैग्रिड से हमले के बारे में जानने के लिए रॉन के साथ उसके घर पहुंचता है , किंतु वहां जादू मंत्री कार्नेलियस फ़ज, लूसियस मेल्फॉय तथा डबलडोर वहां पहुंच जाते हैं। मेल्फॉय डम्बलडोर को हेडमास्टर के पद से हटाने के लिए गवर्नरों का दस्तख़त किया आदेशपत्र दिखता है। फ़ज हैग्रिड को अज्क़ाबान भेज देते हैं। जाते समय हैग्रिड हैरी और रॉन को एक सुराग देता है कि कुछ जानकारी चाहिए तो मकड़ियों का पीछा करो।

हैरी को मायूस मीना वाले बाथरूम में एक एक पुरानी डायरी मिलती है। जिसे कोई वहां फेंक गया था। हैरी जब उस डायरी में अपना नाम लिखता है तो वह डायरी भी उसे अपने बारे में बताने लगती है । डायरी उसे 50 साल पहले के समय में ले जाती है, जहां हैरी देखता है कि टॉम रिडल नाम का लड़का हेग्रिड को एक जानवर को बक्से में बंद करने से रोकता है और कहता है कि - "तहखाने का जानवर मारा जाना चाहिए क्योंकि उसने एक लड़की की जान ले ली है"। किंतु हैग्रिड उस पर हमला कर देता है और वह जानवर बक्से में बंद होने से पहले ही भाग जाता है।

भेस बदल काढ़ा अब तैयार था ,और क्रिसमस की छुट्टियां भी शुरू हो चुकी थी । ज्यादातर विद्यार्थी अपने अपने घर जा चुके थे । केवल कुछ ही विद्यार्थी वहां रुके हुए थे। नागशक्ति हाउस में क्रेब तथा गॉइल सहित मेल्फॉय रुका हुआ था। क्रिसमस के दिन सुबह हर्माइनी की योजना के अनुसार क्रेब और गॉइल को नींद की दवा मिले केक खिला दिए गए ।जिससे वे सो गए । फिर उनके जूते चुराकर और कुछ बाल उखाड़कर वे हैरी और रॉन लड़कियों के बाथरूम में पहुंचे जहां हर्माइनी पहले से ही थी।उन्होंने अपने अपने गिलास के काढ़े में क्रेब और गॉइल के बाल मिलाएं। हर्माइनी ने अपने काढ़े में नागशक्ति हाउस की मिलिसेंट का बाल मिलाया। अलग-अलग बाथरूम में घुस कर उन्होंने काढ़ा पिया , कुछ ही देर में हैरी और रॉन बाहर निकल आए। अब वे दोनों क्रेब और गॉइल में बदल चुके थे। किंतु हर्माइनी बाहर नहीं आई । वे उसके बिना ही मेल्फॉय से मिलने पहुंच गए। वहां उन्हें पता चला कि रहस्यमयी तहखाना पहले भी 50 साल पहले खोला गया था। किंतु मेल्फॉय को यह पता नहीं है कि पहले किसने खोला था, और नाग शक्ति का असली वारिस कौन है ? उसे नहीं लगता की मूर्ख हैरी पॉटर नाग शक्ति का वारिस हो सकता है। हैरी , रॉन अपने वास्तविक रूप में लौट आए। इसके बाद उन्होंने हर्माइनी से फिर पूछा कि क्या बात है? वह क्यों नहीं बाहर आती? हर्माइनी जब बाहर आई तो वह एक बिल्ली में बदल चुकी थी, जो अब अस्पताल में ही ठीक हो सकती थी।

हैरी के हाथ की हड्डियां उग आती हैं। वह अस्पताल से ठीक होकर रॉन तथा हर्माइनी के पास पहुंचता है। हर्माइनी स्नैप की अलमारी से काढ़े के लिए जरूरी सामान चुरा लेती है, जिसमें हैरी स्नेप का ध्यान भटकाकर उसकी मदद करता है। विद्यालय में युद्धकला का प्रशिक्षण क्लब की शुरुआत होती है, जिसमें स्नैप तथा लॉकहार्ट प्रदर्शन करते हैं ।इसके बाद मेल्फॉय तथा हैरी को वहां बुला लिया जाता है । मेल्फॉय सर्पदंश मंत्र का प्रयोग करके अपनी छड़ी से सांप को बाहर निकलता है। वह सांप जस्टिन पर हमला करने ही वाला होता है कि तभी हैरी सांप को हमला करने से रोकता है। सांप उसकी बात मान लेता है। इसके बाद सांप को स्नेप गायब कर देते हैं ।सभी को बहुत अजीब लग रहा था कि हैरी ने सांप से उसकी भाषा में यानी सर्पभाषा में बात की थी । पर हैरी को यही लगा कि वह सामान्य रूप से बोल रहा था। इसके चलते स्कूल में अफवाहें फैलने शुरू हो गई कि हैरी ही नागशक्ति का असली वारिस है, और वही मगलू परिवार के बच्चों पर हमला कर रहा है।क्योंकि जस्टिन एक मगलू परिवार से आया है इसलिए हैरी ने उसके ऊपर सांप छोड़ा था । हैरी उन्हें समझाने का प्रयास करता है परंतु अर्नी मैकमिलन उससे सहमत नहीं होता और वह कहता है कि तुम ही नागशक्ति के वारिस हो। हैरी गुस्से में पैर भटकता हुआ ऊपर पहुंचता है तो वहां वह जस्टिन को और लगभग सिरकटे निक को बेजान हालत में पाता है। प्रोफ़ेसर मैक्गोनेगल उसे डम्बलडोर के ऑफिस में ले जाती हैं।

हैरी, रॉन और हर्माइनी लॉकहार्ट से दस्तखत लेकर लाइब्रेरी से वह काढ़े की पुस्तक निकाल पाने में कामयाब हो जाते हैं । इसके बाद क्विडिच का मैच शुरू होता है, जिसमें हैरी के पीछे एक गेंद जो कि पहलवान है पड़ जाता है। हैरी उससे बचने के के लिए अपनी झाड़ू पर कई कलाबाजियाँ खाता है, जिसे देखकर नागशक्ति के विद्यार्थी उसका मजाक उड़ाते हैं। मेल्फॉय उसकी हंसी उड़ाने में इतना मग्न हो जाता है कि सुनहरी गेंद को देख ही नहीं पाता, जो उसके ठीक सिर के ऊपर उड़ रही होती है। हैरी पर पहलवान हमला कर देता है फिर भी हैरी किसी प्रकार सुनहरी गेंद को पकड़ लेता है और जमीन पर धाड़ से गिरता है। लॉकहार्ट उसके ऊपर कुछ मंत्र पढ़ते हैं जिससे उसके हाथ की हड्डियां गल जातीं हैं । अस्पताल में जाकर मैडम पॉमफ्री उसकी हड्डियां उगाने के लिए उसे एक रात रोककर रखती हैं ।उसी रात में उसके पास डॉबी आता है और उसे बताता है कि उसे यहां नहीं रहना चाहिए था । हैरी पॉटर को रोकने के लिए डॉबी ने कितने प्रयास किए थे। वह बताता है कि उसने ही बैरियर का गेट बंद कर दिया था और आज पहलवान भी उसी ने हैरी के पीछे लगाया था। वह बार-बार विनती करता है कि यहां कुछ घटनाएं ऐसी होने वाली है जिनमें हैरी का यहां रहना ठीक नहीं होगा। तभी वहां बाहर से कुछ आहटें मिलती हैं और डॉबी चला जाता है ।बाहर से डबलडोर प्रोफ़ेसर मैक्गोनिगल कॉलिन क्रीवी को लेकर पहुंचते हैं, जो बेजान हो चुका है और तभी डंबलडोर कहते हैं कि- अब यह तय हो चुका है कि रहस्यमयी तहख़ाना खुल चुका है।

जब मिसेज़ नॉरिश को स्टैंड पर टँगा हुआ विद्यार्थियों ने देखा तो सभी असमंजस में पड़ गए। तभी वहाँ डम्बलडोर पहुंच गए और लॉकहार्ट के ऑफिस में पहुंच कर उन्होंने उस बिल्ली का मुआयना किया। फ़िल्च ने बिल्ली को मारने का आरोप हैरी पर लगाया ,किन्तु डम्बलडोर ने बताया कि बिल्ली मरी नहीं है बल्कि बेजान की गई है। हर्माइनी प्रोफेसर बिन्स की क्लास में उनसे तहख़ाने के बारे में पूछती है। वे पूरी कहानी बताते हैं कि नागेश नागशक्ति ने हॉगवर्ट्स में एक तहख़ाना बनवाया था, पर यह एक कल्पना मात्र है। हैरी, रॉन और हर्माइनी ड्रेको मेल्फॉय को नागशक्ति का वारिस होने की सम्भावना पर विचार करते हैं। हर्माइनी भेस बदल काढ़े की मदद से नागशक्ति के विद्यार्थी बनकर ड्रेको का भेद पता करने की राय देती है। इसके लिए लाइब्रेरी की प्रतिबन्धित खण्ड से पुस्तक लेनी होगी ।

हो रही बारिश में क्विडिच प्रेक्टिस करके हैरी जब प्रवेश हॉल में पहुंचता है तो उसे वहाँ गरुणद्वार का भूत लगभग सिरकटा निक मिलता है जो बहुत उदास दिख रहा है। हैरी के पूछने पर वह हैरी को बताता है और तभी वहाँ फ़िल्च अपनी बिल्ली सहित आ जाता है। वह हैरी को कीचड़ फैलाने के अपराध में सज़ा देने के लिए अपने साथ ले जाता है किंतु तभी पीब्ज़ ऊपर की मंजिल पर धमाका करता है। फ़िल्च हैरी को वहीं छोड़ ऊपर चला जाता है। हैरी सज़ा से बच जाता है। सिरकटा निक हैलोविन के दिन अपनी मृत्युदिवस की पार्टी में हैरी को उसके दोस्तों सहित आमन्त्रित करता है। हैरी हामी भर लेता है। हैरी, रॉन और हर्माइनी निक की पार्टी में पहुँचते हैं। वहाँ से लौटते हुए हैरी को फिर वही अदृश्य आवाज़ सुनाई देती है। और फिर दीवार पर लिखी इबारत को पढ़ कर वे हैरान रह जाते हैं। फ़िल्च की बिल्ली मिसेज़ नॉरिश बेजान होकर मशाल टांगने के स्टैंड पर पूंछ से लटक रही थी। तभी हैलोवीन की पार्टी समाप्त हो जाती है और विद्यार्थियों को भीड़ वहाँ पहुंच जाती है।

हैरी सहित गरुणद्वार की टीम जब क्विडिच प्रेक्टिस के लिए मैदान में पहुँचते हैं तभी वहाँ नागशक्ति हाउस की टीम भी पहुंच जाती है जिसके सभी खिलाड़ी नई निम्बस2001 झाडूएँ लिए हुए हैं। मेल्फॉय उनकी टीम का नया खोजी है।मेल्फॉय गरुणद्वार टीम का मज़ाक उड़ाता है । हर्माइनी उसे जवाब देते हुए कहती है कि गरुणद्वार में कोई भी रिश्वत देकर नहीं आया है। यह सुनते ही मेल्फॉय हर्माइनी को बदज़ात बोल कर थूक देता है। रॉन मेल्फॉय पर अपनी छड़ी का प्रयोग करता है परन्तु टूटी होने के कारण छड़ी रॉन पर ही उलट जाती है। रॉन के मुँह से लगातार घोंघे निकलने शुरू हो जाते हैं। दोपहर में हॉल में पहुंचने पर मैक्गोनेगल हैरी और रॉन को उनके पनिशमेंट के बारे में बताती हैं। रॉन को बिना जादू किए ट्रॉफ़ी रूम में ट्रॉफ़ी चमकाने की सज़ा मिली।हैरी को लॉकहार्ट के पत्रों वाले लिफाफों पर पता लिखने का काम करना पड़ा। वही हैरी को अदृश्य आवाज़ सुनाई देती है। जैसे कोई मारने काटने के बारे में कह रहा हो। यह लॉकहार्ट को सुनाई नहीं देती।

इस अध्याय में नाश्ते के समय रॉन की मम्मी का भोंपू रॉन के लिए आता है। जिससे सभी उसकी ओर देखकर हँसने लगते हैं।इससे परेशान हैरी और रॉन जब जादुई पौधों और जड़ी बूटियों की क्लास में जाते हैं तो बीच में ही लॉकहार्ट मिल जाते हैं जो हैरी को तमाम समझाइस देते हैं कि प्रसिद्धि के लिए तुम अभी काफ़ी छोटे हो। जादुई पौधों और जड़ी बूटियों की क्लास में मन्त्रकवच को गमलों में रोपने का काम प्रोफेसर स्प्राउट विद्यार्थियों को सिखातीं हैं। अगली कक्षा में लॉकहार्ट जो कि गुप्त कलाओं से रक्षा के प्रोफेसर हैं वे अपनी क्लास में पिंजरे में से छोटे पिशाचों को बाहर छोड़ देते हैं जो इतना उत्पात मचाते हैं कि स्वयं लॉकहार्ट एक टेविल के नीचे छिप जाते हैं।

इस अध्याय में- हॉगवर्ट्स ट्रेन से स्कूल जाने के लिए वीज्ली परिवार के सभी विद्यार्थी किंग्सक्रॉस स्टेशन पर पौने दस नम्बर प्लेटफार्म पर पहुँचने के लिए बैरियर पार करते हैं, पर हैरी और रॉन बैरियर पार नहीं कर पाते। न जाने क्यों बैरियर उनके लिए नहीं खुलता। रॉन और हैरी मिस्टर वीज्ली की कार से स्कूल पहुँचते हैं। जहाँ अनियंत्रित होकर कार लड़ाकू पेड़ से टकरा जाती है और पेड़ उन पर हमला कर देता है। किसी तरह वे बच जाते हैं। प्रोफेसर स्नेप उन्हें अपने ऑफिस में ले जाते हैं जहाँ वे प्रोफेसर मैक्गोनेगल और डम्बलडोर को भी बुला लेते हैं। उन्हें स्कूल से बाहर होने के पूरे आसार नज़र आते हैं पर प्रोफेसर मैक्गोनेगल उन्हें नहीं निकालतीं। और आख़िर वे अपने गरुणद्वार हाउस में पहुंच जाते हैं जहाँ उनका बड़ा स्वागत होता है।