尽管在帕哈贝尔的职业生涯中，大多数时间是一个忙碌的管风琴手。可他也是一位非常多产的作曲家。他为管风琴、羽管键琴、室内乐团和各种声乐体裁作曲。也为路德教会的仪式创作了管风琴音乐。帕哈贝尔创作的管风琴赞美诗符合他与埃尔福特天主教教堂的合同中规定的要求，而庄严的赋格曲则用于加强纽伦堡圣塞巴尔杜斯的晚祷。在他的管风琴音乐中，他也培养了非礼拜风格的托卡塔，前奏曲，利切卡尔（ricercare有赋格曲和寻求曲的意思），幻想曲，赋格和恰空(chaccona)。他的其他键盘音乐包括赋格、组曲和变奏曲。他的室内乐制作精良，从17世纪晚期的德国风格中获益良多，这种风格巧妙地结合了活力和抒情。帕赫贝尔的声乐表现了他对许茨（Schütz）一代及其追随者的风格和手段的掌握。与管风琴音乐相比，它的戏剧性表达范围更广，而且唱腔的要求也相当高。他最早的作品是1679年的两首咏叹调。这些带有拉丁文字的作品，创作时间几乎可以追溯到他生命的最后十年。