تنقية المياه من الملوثات الطبيعية والكيميائية، تحد كبير أمام السلطات في جنوب أفريقيا. فنحو تسعين في المئة من محطات تنقية المياه بجنوب أفريقيا لا تراعي المعايير الدنيا وتلقي بالمياه المستعملة الملوثة في الأنهار والسدود.