Biodiversité et écosystèmes (2022-2023) - Virginie Courtier-Orgogozo

Virginie Courtier-Orgogozo

Biodiversité et écosystèmes (2022-2023)

Collège de France

Penser le vivant autrement

Séminaire - Marc-André Sélosse : La symbiose, une autre définition du vivant

La symbiose est l'interaction à bénéfices réciproques entre deux organismes d'espèce différente. D'un point de vue évolutif, elle doit se traduire par une amélioration réciproque de la valeur sélective. La symbiose est impliquée dans de nombreuses fonctions des organismes et la récente découverte du rôle des microbiotes a encore amplifié cette omniprésence. Nous verrons comment la symbiose peut rester stable face au risque que l'un des partenaires exploite l'autre.

Marc-André Selosse est professeur du Muséum national d'histoire naturelle à Paris et aux universités de Gdansk (Pologne) et Kunming (Chine). Ses recherches portent sur l'écologie et l'évolution des symbioses, notamment comme responsable de l'équipe Interactions et évolution végétale et fongique au sein de l'Institut de systématique, évolution, biodiversité (UMR 7205). Il travaille sur les symbioses mycorhiziennes unissant des champignons du sol aux racines des plantes. Président de la fédération BioGée et membre de l'Académie d'agriculture de France, il est éditeur de quatre revues scientifiques internationales. Ses articles de recherche et de vulgarisation (> 200 de chaque) sont sur http://isyeb.mnhn.fr/fr/annuaire/marc-andre-selosse-404.

Virginie Courtier-Orgogozo

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Penser le vivant autrement

Les interactions dans le monde vivant

Dans le monde vivant, il existe de nombreuses interactions à tous les niveaux. L'esprit humain est tenté de décomposer en éléments, mais les éléments du vivant sont extrêmement interconnectés. Prendre en compte ces interactions est indispensable pour comprendre le vivant et pour prédire sa dynamique future. Origine des mitochondries et chloroplastes, Wolbachia, holosymbiontes. Réticulation du vivant. Dépendances métaboliques.

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Séminaire - Bruno David : À l'aube de la sixième extinction

Bruno David, président du Muséum national d'histoire naturelle, Paris

Résumé

Tout le monde est familier du terme « biodiversité ». Mais que recouvre ce vocable simple en apparence ? On entend à l'envi « la biodiversité est en crise ». Sommes-nous à l'aube d'une sixième extinction dont nous serions la cause ? Que peuvent nous apprendre les crises du passé géologique de la Terre ? Pouvons-nous encore redresser la barre ? Quels sont nos leviers d'action ? La vraie question ne serait-elle pas éthique, une éthique pour la planète ?

Virginie Courtier-Orgogozo

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La fonctionnalisation et la hiérarchisation du vivant

Les humains occupent une place comme les autres dans l'arbre du vivant. Chaque espèce vivante actuellement est dotée de propriétés remarquables. Néanmoins, les humains occupent aujourd'hui une place particulière sur la Terre : ils ont un fort impact sur les écosystèmes et c'est la première fois dans l'histoire du Vivant qu'une population peut réfléchir et faire des choix sur le futur de la planète. L'être humain ne peut s'empêcher d'attribuer des valeurs aux éléments avec lesquels il interagit. Exemple des espèces nuisibles et des espèces invasives. La fonctionalisation du vivant, notamment avec la notion de services écosystémiques, incite à la substitution et au remplacement des êtres vivants. Or il semble exister une valeur intrinsèque profonde attribuée à la nature et au vivant, portée en chacun de nous.

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Séminaire - Laure Ségurel : Histoire évolutive des humains : ce que nous a appris l'ADN

Laure Ségurel, Université Claude Bernard Lyon 1

Résumé

La génétique des populations est une discipline visant à retracer l'histoire évolutive des populations et des espèces grâce à l'analyse de leurs séquences ADN. Cette alternative à l'archéologie nous permet de mieux comprendre les mouvements des populations du passé, leurs fluctuations en taille, leurs métissages avec d'autres populations archaïques et leurs adaptations aux changements environnementaux. Nous ferons ainsi une lecture biologique de l'histoire de nos ancêtres pour mieux comprendre qui nous sommes et d'où nous venons.

Biographie

Laure Ségurel s'intéresse aux processus évolutifs qui ont façonné la diversité génétique des populations humaines. Après un doctorat en anthropologie génétique à Paris, elle a effectué ses études postdoctorales en biologie évolutive à l'université de Chicago. Actuellement recrutée au CNRS au LBBE (Lyon), elle cherche à comprendre comment les populations humaines se sont adaptées aux changements d'alimentation. D'une part, elle s'intéresse aux adaptations qui ont eu lieu lors de la révolution néolithique, une transition culturelle majeure marquée par les débuts de l'agriculture et de l'élevage. D'autre part, elle étudie comment la plus récente révolution industrielle a affecté le microbiote intestinal.

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Comment les séquences d'ADN ont modifié notre vision du monde vivant

Le séquençage et la comparaison des séquences d'ADN ont permis de découvrir des phénomènes importants liés au vivant qui étaient restés jusque là cachés à nos sens. Reconstitution des liens de parenté entre espèces, biogéographie, évolution des traits de caractère. Les points chauds génétiques de l'évolution convergente. Hybridations, transferts horizontaux de gènes. Diversité nucléotidique et histoire passée des populations.

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Séminaire - Sylvain Charlat : Émergence de l'individualité darwinienne : vers une perspective métaévolutive

Sylvain Charlat, chercheur au CNRS, laboratoire de Biométrie & Biologie Évolutive

Résumé

Des conflits intragénomiques aux symbioses mutualistes, les interactions biologiques nous invitent à questionner les fondements d'un concept rarement explicité et pourtant essentiel au raisonnement darwinien : l'individu. L'individu comme « niveau de sélection », c'est à dire comme échelle pertinente d'analyse de la « variance héritable en fitness », source d'évolution adaptative. Le cadre conceptuel des « transitions majeures » nous offre la possibilité de concevoir l'émergence de nouvelles échelles d'individualité à travers l'assemblage et la coopération plus ou moins harmonieuse d'individus d'échelle inférieure : la cellule eucaryote, l'organisme pluricellulaire, la colonie de fourmis, etc. Ce cadre laisse également ouverte la possibilité d'une multiplicité des échelles d'individualité, que les « éléments génétiques égoïstes » tels que la bactérie Wolbachia ou les éléments transposables nous permettront d'illustrer. Mais est-il à même d'expliquer l'émergence première de l'individualité ? Aux origines de la vie, c'est-à-dire, par définition, sans individus, comment l'évolution a-t-elle pu opérer ? Plus généralement, comment concevoir l'émergence des processus Darwiniens, sans reposer, paradoxalement, sur des individus préformés ? Je chercherai principalement à démontrer l'importance et la difficulté de ce problème, pour partager ensuite le souhait, sinon la possibilité, de sa résolution à travers une perspective métaévolutive.

Biographie

Les travaux de Sylvain Charlat portent sur l'évolution des interactions biologiques, entre conflit et coopération, à travers les échelles d'organisation. Ces questions sont abordées par des approches de génomique évolutive, de modélisation, et par des explorations plus conceptuelles des fondements de la théorie de l'évolution. Il a rejoint le CNRS en 2007 à Lyon, au sein du laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive, après une thèse à l'institut Jacques Monod, et un séjour post-doctoral à Londres et en Polynésie Française, qui portaient sur la bactérie intracellulaire Wolbachia, grande manipulatrice de la reproduction sexuée chez les arthropodes.

Virginie Courtier-Orgogozo

Biodiversité et écosystèmes (2022-2023)

Collège de France

Penser le vivant autrement

Le monde vivant est enchâssé dans un processus historique

La métaphore de la machine s'applique mal aux éléments vivants. Chaque cellule dérive d'une cellule. Chaque être vivant dérive d'un autre être vivant. La dynamique future d'un écosystème ne se comprend qu'à la lumière de son histoire passée. Les organismes synthétiques dérivent d'autres êtres vivants. La relation génotype-phénotype se comprend mieux en termes de différences. Les organismes vivants accumulent au fil des générations des différences génétiques par rapport à leurs ancêtres.

Leçon inaugurale - Virginie Courtier-Orgogozo : Penser le vivant autrement

Biodiversité et écosystèmes (2022-2023)

Sentir la chaleur des rayons du soleil sur la peau. Suivre des yeux une nuée d'oiseaux s'éloigner dans le lointain. Si nos sens nous permettent d'appréhender le monde qui nous entoure et d'agir en conséquence, ils introduisent aussi des biais dans notre compréhension de la biodiversité et de sa dynamique : biais vers les espèces de notre taille, les espèces terrestres, les espèces qui interagissent avec nous, les adultes, les mâles, les caractères morphologiques, notre vision occidentale du monde... Prendre conscience de ces biais humains concernant le monde vivant et tenter de les dépasser constitue une étape essentielle pour mieux faire face à la crise de la biodiversité actuelle.

Virginie Courtier-Orgogozo, directrice de recherche au CNRS, professeure associée à l'École polytechnique, professeure invitée du Collège de France