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#腸内細菌相談室 の鈴木大輔です。
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腸内細菌相談室は"週刊腸内細菌"というメルマガを毎週金曜日 20:00に発信しています!さらにディープな腸内細菌の世界を除きませんか?
https://www.mag2.com/m/0001699083.html
腸内細菌相談室では、腸内細菌によって良いやつもいれば悪いやつもいることをお伝えしています。今回登場するBacteroides fragilis (フラジリス菌)は、悪いやつもそうでないやつもいる点、ややこしいです。今回紹介する悪いタイプのフラジリス菌は毒素を出して、腸管バリアの一部を破壊しますが、その仕組みについてはよくわかっていませんでした。そこで、その謎に迫った研究をご紹介します。
参考文献📖
White MT, Wang K, Zhang H, Eckhard U, Hullahalli K, Chen J, Wu S, Geis AL, Zhang J, Queen J, Gomis-Ruth FX, Waldor MK, Dong M, Sears CL. A pro-carcinogenic bacterial toxin binds claudin-4 to cleave E-cadherin. Nature. 2026 Apr 22. doi: 10.1038/s41586-026-10375-0. Epub ahead of print. PMID: 42020735.
こちらもチェック🔍️
#184 Bacteroides fragilisとはどのような腸内細菌なのか?
https://note.com/chonai_saikin/n/ndabf5a28322c
#154 腸管バリアとしてのタイトジャンクション。
https://note.com/chonai_saikin/n/n45757e23ae2d
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メタジェンセラピューティクス株式会社についてメタジェンセラピューティクス株式会社は「マイクロバイオームサイエンスで患者さんの願いを叶え続ける」ことをミッションとして、腸内細菌研究に基づいた医療と創薬でソーシャルインパクトを生み出す大学発ベンチャーです。順天堂大学の医師と慶應義塾大学、東京工業大学の研究者が共同創業し、「腸内細菌叢移植療法(FMT)」の社会実装と、「FMT起点のリバーストランスレーショナル創薬」を推進しています。
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※本日は論文紹介はございません。
腸内細菌相談室は、この配信活動を開始してから、今回で計500回のエピソードを配信してきました。そこで、第1回で発信した内容をここで復習するとともに、"信頼できる腸内環境の情報へ到達するために"はどうすればよいのか、改めて考えます。
参考文献📖
火星に移住する前に、Access: 20260424、URL: https://note.com/mgtx_ceo/n/n14b28d53d639
プレスリリース例:ベージュ細胞を誘導する食餌と腸内細菌を同定、Access: 20260305、URL: https://www.keio.ac.jp/ja/press-release/20260305-1/
論文例:日本語の総説から、光岡 知足, 腸内菌叢研究の歩み, 腸内細菌学雑誌, 2011, 25 巻, 2 号, p. 113-124.
https://www.jstage.jst.go.jp/article/jim/25/2/25_2_113/_article/-char/ja/
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私たちの誰もがお腹の中に携えている腸内細菌叢。これら細菌の腸内環境への定着は、乳幼児にて急激に起こり、その後も緩やかに変化していくという特徴があります。中でも、乳幼児期に経験する"離乳"は、食べ物が質的・量的に変化することから、腸内細菌叢に大きな影響を与えることが分かっています。この変化が、腸管免疫の調節に重要であることが、エピジェネティクスの観点から見えてきました。
主要組織適合遺伝子複合体について🦠
https://open.spotify.com/episode/4vLf98ZDiUnZ39qtUbORhT?si=O63T-he8Tn2OqPYMH94tcg
エピジェネティクスについて🧬
https://open.spotify.com/playlist/7o2CFDglsRT1lD1q8E3U9p?si=P6rf4jA1R_GYKYM5TZcYcA
参考文献📖
今回紹介した論文:
Yang, L., Peery, R.C., Zhou, S. et al. Weaning drives microbiome-mediated epigenetic regulation to shape immune memory in mice. Nat Microbiol 11, 1064–1079 (2026). https://doi.org/10.1038/s41564-026-02295-6
Weaning drives microbiome-mediated epigenetic regulation to shape immune memory in mice - Nature MicrobiologyGut microbial changes promoted by weaning in mice result in ewww.nature.com
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脂肪の燃焼。健康な体を目指す多くのヒトにとって、運動をするモチベーションを与えるキーワードではないでしょうか?多くのヒトにとっての関心事となる脂肪の燃焼には、腸内細菌が深く関わっているようです。
参考文献📖
今回紹介した論文:
Tanoue, T., Nagayama, M., Roochana, A.J.A. et al. Microbiota-mediated induction of beige adipocytes in response to dietary cues. Nature (2026).
https://www.nature.com/articles/s41586-026-10205-3
プレスリリース:
ベージュ細胞を誘導する食餌と腸内細菌を同定、Access: 20260410、URL: https://www.keio.ac.jp/ja/press-release/20260305-1/
参考資料:ベージュ細胞についてのわかりやすいページ:脂肪細胞の分化メカニズム、Access: 20260410、URL: https://www.md.tsukuba.ac.jp/basic-med/biochem/gene/research3.html
Microbiota-mediated induction of beige adipocytes in response to dietary cues - NatureIn mice, a low-protein diet leads to a gut-microbiota-drivendoi.org
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気が付きましたでしょうか!ありがたいことに、2026年度も、本番組はメタジェンセラピューティクス株式会社の提供でお送り致します。頼まれたわけでは無いのですが、会社のこれからを応援する1人の研究者として事業内容を広めたい気持ちがあるので、先日放送されていたテレビ朝日の番組を共有致します。
BooSTAR -スタートアップ応援します- 3月22日(日)放送分 うんちで病気を治す時代に! ~あなたのうんちが誰かの役に立つ話~|報道/ドキュメンタリー|見逃し無料配信はTVer!人気の動画見放題「BooSTAR -スタートアップ応援します-」3月22日(日)放送分「うんちで病気を治す時代に! ~あなたのうんちが誰かtver.jp
さて、今回のテーマは、新技術によって、腸内環境を住処とする腸内細菌がより良く見える様になってきたというお話です。
参考文献📖
今回紹介した論文:
Ntekas, I., Takayasu, L., McKellar, D.W. et al. Spatial transcriptomics maps host–gut microbiome biogeography at high resolution. Nat Microbiol (2026).
https://doi.org/10.1038/s41564-026-02286-7
Spatial transcriptomics maps hostâgut microbiome biogeography at high resolution - Nature MicrobiologyBulk polyadenylation improves the capture of microbial RNA, edoi.org
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今回は、これまで取り扱って来なかった疾患、脳卒中 (Stroke)についてお話します。脳卒中とは、国立循環器病研究センターの記述を引用すると、"人間の身体の働きを中枢で統括している「脳」の血管が、詰まったり破れたりすることで、急に脳の一部の働きが悪くなり、それによって急に身体の働きが悪くなる病気です。"とされています1)。日本人の死因の第4位、寝たきりになる原因の第1位とも説明されています1)。私の祖父も脳卒中で入院し、寝たきりになりました。脳卒中は、細菌感染症を合併するようで、そこに腸内細菌が関係しているようです。
参考文献📖
1) 脳卒中、国立研究開発法人 国立循環器病研究センター、Access: 20260325、URL: https://www.ncvc.go.jp/hospital/pub/knowledge/disease/stroke-2/
今回紹介した論文:Peh A, Dinakis E, Nakai M, Muralitharan RR, Rupasinghe S, Wilson JL, Wong CHY, Jama HA, Barker CMO, Modarresi M, Kemp-Harper BK, Zheng T, Marques FZ, Broughton BRS. Gut bacteria presence in the brain is increased after ischemic stroke in mice. Gut Microbes. 2026 Dec 31;18(1):2617694. doi: 10.1080/19490976.2026.2617694. Epub 2026 Jan 26. PMID: 41586772; PMCID: PMC12851396.
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腸内環境の悩みに多いのは便秘です。便秘によりQOLは下がる一方で、その有病率は非常に高いです。そんな便秘の要因の一つは、腸の特殊な動き:蠕動運動にあります。そんな蠕動運動に深く関係する神経伝達物質、セロトニンを腸内細菌たちが作り出しているようです。
参考文献📖1) セロトニン, 生活習慣病などの情報 健康日本21 アクション支援システム Access: 20260317, URL: https://kennet.mhlw.go.jp/information/information/dictionary/h
2) Moretti CH, Grasset E, Zhu J, Yang G, Olofsson LE, Khan MT, Bergh PO, Oh JH, Lundqvist A, van Gils T, Krämer M, Olsson LM, Patel P, Mitteregger M, Monges DE, Dwibedi C, Krautkramer KA, Koopman N, Henricsson M, Macpherson AJ, Schwartz T, Grompone G, Pijkeren JV, Tremaroli V, Roos S, Simrén M, Bäckhed F. Identification of human gut bacteria that produce bioactive serotonin and promote colonic innervation. Cell Rep. 2025 Oct 28;44(10):116434. doi: 10.1016/j.celrep.2025.116434. Epub 2025 Oct 20. PMID: 41118765.
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人間を含めた多くの動物は、五感を活用して生きています。いずれの感覚も、自然界を生き抜く上で必要な情報の収集に役立ちます。一方で、五感に次ぐ感覚、"第六感" (Sixth Sense)という言葉がありますね。コトバンクのデジタル大辞泉にて、第六感は"理屈では説明のつかない、鋭く本質をつかむ心の働き。"や"勘"と説明されていました。そんな第六感は英語でGut Feelingと表現されますが、本当にGut=腸が感覚器官としての機能を担っているようです。
参考文献📖
Liu, W.W., Reicher, N., Alway, E. et al. A gut sense for a microbial pattern regulates feeding. Nature 645, 729–736 (2025). https://doi.org/10.1038/s41586-025-09301-7
1) 第六感、デジタル大辞泉、コトバンク、Access: 2026/3/12、URL: https://kotobank.jp/word/%E7%AC%AC%E5%85%AD%E6%84%9F-164922
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科学的な知見は、一般に公開されることで流通し、次の知見の創出、発見に繋がっていきます。特に、多様な種、代謝が存在する生物においては、流通している知見が整備されることで、利用しやすく、次の発見につながりやすくなります。そんな、生物学の発見を支えるのが、知見が体系的にまとめられているデータベースです。今日は、腸内細菌研究ではよく知られたデータベースのお話です。
参考文献📖
Manghi P, Antonello G, Schiffer L, Golzato D, Wokaty A, Beghini F, Mirzayi C, Long K, Gravel-Pucillo K, Piccinno G, Gamboa-Tuz SD, Bonetti A, D'Amato G, Azhar R, Eckenrode K, Zohra F, Giunchiglia V, Keller M, Pedrotti A, Likhotkin I, Elsafoury S, Geistlinger L, Blanco-Miguez A, Thomas AM, Zolfo M, Ramos M, Valles-Colomer M, Tamburini S, Asnicar F, Jones HE, Huttenhower C, Carey V, Davis S, Pasolli E, Oh S, Segata N, Waldron L. Meta-analysis of 22,710 human microbiome metagenomes defines an oral-to-gut microbial enrichment score and associations with host health and disease. Nat Commun. 2025 Dec 23;17(1):196. doi: 10.1038/s41467-025-66888-1. PMID: 41436448; PMCID: PMC12780261.
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この腸内細菌相談室では、腸内細菌の基礎的な研究から腸活に至るまで、腸内環境について幅広く取り扱ってきました。身近なところでは、便秘について数多く取り上げてきており、10以上の記事・ポッドキャストエピソードを執筆・公開してきました。そんな便秘について、腸内細菌が直接的に関与する仕組みが日本の研究チームによって明らかになったのでご紹介します。
便秘に関するエピソードのプレイリスト
Hamaguchi T, Gibo N, Ohara M, Ito M, Ogura T, Takeda JI, Nishiwaki H, Zhao F, Kinoshita-Daitoku R, Hattori M, Nonogaki K, Maeda T, Kashihara K, Tsuboi Y, Hirayama M, Fujishiro M, Kawashima H, Ohno K. Bacterial constipation: Mucin-degrading intestinal commensal bacteria cause constipation. Gut Microbes. 2026 Dec 31;18(1):2596809. doi: 10.1080/19490976.2025.2596809. Epub 2026 Feb 18. PMID: 41709439.
プレスリリース:https://www.nagoya-u.ac.jp/researchinfo/result/2026/02/post-945.html
紹介
日本経済新聞の記事:
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOSG203Q70Q6A220C2000000/
参考文献📖
1) 便秘について:日本消化器病学会関連研究会 慢性便秘の診断・治療研究会編:慢性便秘症診療ガイドライン2017. 南江堂, 東京. 2017
2) 結果の概要、2019年 国民生活基礎調査の概況、厚生労働省、Access: 20230313, URL: https://www.mhlw.go.jp/toukei/saikin/hw/k-tyosa/k-tyosa19/index.html
Hamaguchi T, Gibo N, Ohara M, Ito M, Ogura T, Takeda JI, Nishiwaki H, Zhao F, Kinoshita-Daitoku R, Hattori M, Nonogaki K, Maeda T, Kashihara K, Tsuboi Y, Hirayama M, Fujishiro M, Kawashima H, Ohno K. Bacterial constipation: Mucin-degrading intestinal commensal bacteria cause constipation. Gut Microbes. 2026 Dec 31;18(1):2596809. doi: 10.1080/19490976.2025.2596809. Epub 2026 Feb 18. PMID: 41709439.
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