Et si, pour sauver l’humanité, il fallait stocker… des excréments ? Aussi surprenant que cela puisse paraître, c’est exactement l’idée derrière le “Microbiota Vault”, un projet scientifique inédit destiné à préserver ce que nous avons de plus précieux… dans nos intestins.

Inspiré par la célèbre “banque de graines du Svalbard”, conçue pour protéger la biodiversité végétale en cas de catastrophe mondiale, ce nouveau “coffre-fort du microbiote” veut faire la même chose… avec nos bactéries intestinales. Dans un article publié le 27 juin 2025 dans Nature Communications, 25 chercheurs de renom ont détaillé leur initiative, née de l’urgence de conserver la diversité microbienne humaine menacée par notre mode de vie moderne.

Car nos microbiotes intestinaux – ces milliards de bactéries, levures et virus qui peuplent notre tube digestif – jouent un rôle essentiel pour la digestion, l’immunité, la santé mentale, et même le métabolisme. Or, leur diversité s’effondre à mesure que les populations adoptent une alimentation ultra-transformée, consomment trop d’antibiotiques, vivent en environnement aseptisé… Résultat : des microbes ancestraux, présents depuis des millénaires, disparaissent sans retour.

Le “Microbiota Vault” veut y remédier. Basé sur le campus de l’université de Bâle, en Suisse, ce projet a déjà collecté plus de 2 000 échantillons de selles humaines et d’aliments fermentés traditionnels. Ces échantillons proviennent de populations rurales, souvent isolées, qui ont conservé un microbiote riche et ancien, très différent de celui des sociétés industrialisées.

Le but ? Créer une arche de Noé microbienne, un réservoir de biodiversité invisible mais vitale, à conserver pour les générations futures. En cas de pandémie, de catastrophe climatique, ou simplement de crise de santé publique liée à l’appauvrissement du microbiote humain, ces échantillons pourraient permettre de réintroduire certaines souches bénéfiques dans nos intestins via des greffes fécales ou des probiotiques.

Mais le projet soulève aussi des questions éthiques : qui “possède” ces microbes ? Comment respecter les populations donneuses ? Les chercheurs plaident pour une coopération internationale éthique et équitable, à l’image de la convention de Nagoya sur la biodiversité.

En résumé, ce nouveau coffre-fort ne contient pas d’or ni de graines… mais une richesse invisible, précieuse, et irremplaçable : notre biodiversité intérieure. Dans un monde où tout s’uniformise, préserver ces microbes, c’est peut-être préserver notre capacité à survivre. Oui, l’avenir de la santé humaine pourrait bien passer… par une poignée de selles congelées.

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