医学遗传前沿

EP38 无处不在的体细胞变异


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本期节目,我们聊一聊体细胞突变(somatic mutations)这一近年迅速发展的研究领域,讨论它如何在健康组织中产生、累积,且如何与非肿瘤疾病息息相关。我们介绍了传统 Duplex-Seq 到 NanoSeq 等超低错误率测序技术是如何突破技术瓶颈,让研究者能够在正常组织中“看到”极低频突变的真实样貌。虽然这些技术的应用,我们近年来发现了体细胞突变与多种复杂疾病的关联,包括免疫疾病、炎症性疾病、心血管病、神经退行性疾病,以及女性健康中的子宫内膜异位症等。

术语列表
  • Somatic Mutation(体细胞突变)出生后发生在体内各种组织细胞的基因突变,不会遗传给下一代。
  • Mosaicism(嵌合现象 / 马赛克现象)由于体细胞突变导致同一个体内存在不同基因型的细胞群。
  • Duplex Sequencing(双链测序)通过分别测量 DNA 正反两条链,只保留两条链均存在的突变,从而极大降低测序错误率。
  • NanoSeq(纳米级超低错误率测序)一种最新的高保真测序技术,通过避免端修复、采用双链一致性策略,让错误率低至 10⁻⁹,可检测极低频体细胞突变。
  • Clonal Hematopoiesis(克隆性造血)血液干细胞带有驱动突变后不断扩张形成的大克隆,与心血管疾病和白血病风险增加相关。
  • Somatic Expansion of STR(体细胞串联重复扩增)神经元或其他细胞中短串联重复序列在体细胞内持续扩增的现象,被认为参与亨廷顿舞蹈病等神经退行性疾病。
相关链接🔬 测序技术与方法
  • NanoSeq 高保真测序技术(Wellcome Sanger Institute)www.sanger.ac.uk
🧬 体细胞突变与疾病机制
  • KRAS 突变与脑动静脉畸形(Brain AVM)Nikolaev et al., NEJM 2018:doi.org
  • KRAS 突变与子宫内膜异位症Anglesio et al., NEJM 2017:doi.org
  • 阿尔茨海默病与神经元体细胞突变Lodato et al., Science 2018:doi.org
  • 亨廷顿舞蹈病与神经元体细胞短串联重复扩增(STR expansion)Ciosi et al., Nature Neuroscience 2019:doi.org
  • 克隆造血(CHIP)与心血管疾病的关联Jaiswal et al., NEJM 2017:doi.org

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医学遗传前沿By senzhao

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