What's Next|科技早知道

S8E07 | 还不能预测万物,聊聊AlphaFold3的创新和局限


Listen Later

北京时间 5 月 8 日,谷歌 DeepMind 和谷歌旗下子公司 Isomorphic Labs 联合发布了其生物学预测模型 AlphaFold 的最新版本——AlphaFold 3。这是在 AlphaFold 2 发布三年后,谷歌在 AI 生物学领域的又一次突破。和前代相比,AlphaFold 3 的预测效率有了显著提升,而且在蛋白质本身以外,它还能够预测「几乎所有分子类型」的蛋白质复合物结构,有望大幅提升新药研发的效率。

那么具体来看,AlphaFold 3 有什么样的区别和改进?由技术关照现实,这项技术在工业界,尤其是药物设计领域将会带来怎样的应用前景?又会带来哪些变革?本期节目邀请到来自业内和学界的嘉宾,硅谷投资人张璐和清华大学生命学院博士后徐魁,分别从商业与技术的视角深度探讨 AlphaFold 3,聊聊我们应当如何看待 AI 在生命科学领域的应用,以及这项技术目前的优缺点和未来趋势。

「声动活泼」公众号上也同步整理了本期节目的要点,如果你喜爱本期节目或对节目内容感到好奇,欢迎在微信搜索「声动活泼」查看最新文章。

感谢图拉斯对本期节目的支持~

图拉斯是创立于 2012 年的创新、高品质的 3C 数码品牌,凭借完善的自主研发体系,严苛的品质把控和独特的设计理念,成为行业领导者,多款产品荣获国际设计大奖。如今已经发展成为横跨四大洲、服务 148 个国家和地区的全球化品牌,拥有超过 6000 万用户。

图拉斯 yoga 伸缩线充电器,点击链接下单: https://sourl.cn/J6Rtkp (京东) 、https://sourl.cn/aWh4t4 (天猫)

  • 双口快充——双口共 40WPD 多设备同时快充
  • 集成无级调节伸缩线—— 0.68m 随停随收
  • 内嵌式折叠脚——安心收纳不刮包
  • 专利转轴——高精度压铸锌合金转轴,持久耐用
  • 本期人物

    丁教 Diane,「声动活泼」联合创始人、「科技早知道」主播
    张璐,硅谷 Fusion Fund 创始合伙人,达沃斯全球青年领袖,斯坦福客座讲师
    徐魁,清华大学生命学院博士后,研究方向为计算生物学、人工智能生物学
    雅娴,「科技早知道」监制

    主要话题

    [03:00] 相比 AlphaFold 2,AlphaFold 3 有何区别与改进?
    [05:25] Isomorphic lab:专注商业化的帮手
    [09:30] 竞争对手在做什么?同领域中美竞争格局
    [14:29] AlphaFold 3 无法大幅缩短药物研发周期
    [17:53] AlphaFold 3 模型优化:流水线整合为一体化
    [22:24] 医药领域 AI 应用:短期被高估,长期被低估
    [29:58] 技术的商业潜力:改变世界也创造财富
    [32:28] 从药厂 AI 应用说起,开源是行业发展必然吗?
    [39:39] 冲突、幻觉、手性错误?AlphaFold 3 仍有局限性
    [42:08] 指数级增长的未来与跨学科合作趋势

    所涉部分术语

    David Baker:美国华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所主任。他的实验室专注于蛋白质结构预测与蛋白质设计的工具开发。节目中提到的多个与 AlphaFold2/3 竞争的生物分子预测软件均由 David Baker 实验室主导开发,如 RoseTTAFoldRoseTTAFold All-atomRoseTTAFold2NA
    Autodock Vina :它是一个开源的分子对接(docking) 引擎,被广泛用于预测小分子(配体)与蛋白质(受体)之间的结合模式。由美国 The Scripps Research Institute 的 Molecular Graphics Lab 开发。
    MSA:多序列比对(Multisequence Alignment,简称 MSA)是一种生物信息学技术,用于将三个或以上的氨基酸序列进行比对,以找出它们之间的相似性和差异性。在结构预测中,MSA 能够辅助寻找相似序列蛋白并且比对他们的结构特征,提高预测精度。
    Clash:蛋白质模型中,Clash 通常指的是蛋白质内部或蛋白质之间的原子间距离过近,超出了范德华半径所允许的范围,导致的空间冲突或重叠现象。结构预测软件需要尽量减少 Clash 的发生。
    AIDD:即人工智能辅助药物发现 (Artificial Intelligence for Drug Discovery)。
    ESG:在生物制造领域,ESG 代表环境(Environmental)、社会(Social)和公司治理(Governance)三个方面,是衡量企业在可持续发展方面表现的重要指标, 代表了企业在环境责任、社会责任和公司治理方面的表现。

    相关阅读

    Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3
    #54 AI 进军生物界,AlphaFold 的突破 “将改变一切”
    S6E37|如果 AI 就能解锁蛋白质,世界还需要结构生物学家吗?

    幕后制作

    监制:丁教、雅娴、Xinlu
    后期:Jack、迪卡
    商业内容策划:Nene
    运营:George
    设计:饭团

    商务合作

    声动活泼商务合作咨询

    支持我们,加入新一年的播客创新

    2021 年我们发起了「声动胡同会员计划」,这是一个纯支持项目,支持「声动活泼」在播客内容上不断探索和创新。回顾 2023 年,得益于这些支持,「声动活泼」的每档节目都不断突破,不仅荣登苹果中国的年度热门节目榜单,还在 CPA 和喜马拉雅等平台都榜上有名。2024 年全新付费节目「不止金钱」现已上线,欢迎收听。同时,新一季「跳进兔子洞」即将上线,敬请期待!


    加入我们
    声动活泼正在招聘全职「节目监制」、「节目营销」、「商业化项目管理」,查看详细讯息请 点击链接。如果你已准备好简历,欢迎发送至 [email protected], 标题请用:姓名+岗位名称。

    关于声动活泼

    「用声音碰撞世界」,声动活泼致力于为人们提供源源不断的思考养料。
    我们还有这些播客:声动早咖啡声东击西吃喝玩乐了不起反潮流俱乐部泡腾 VC商业WHY酱跳进兔子洞
    欢迎在即刻、微博等社交媒体上与我们互动,搜索 声动活泼 即可找到我们。
    期待你给我们写邮件,邮箱地址是:[email protected]


    欢迎扫码添加声小音,在节目之外和我们保持联系。

    Special Guests: 张璐, 徐魁, and 雅娴.

    ...more
    View all episodesView all episodes
    Download on the App Store

    What's Next|科技早知道By 声动活泼

    • 4.7
    • 4.7
    • 4.7
    • 4.7
    • 4.7

    4.7

    173 ratings


    More shows like What's Next|科技早知道

    View all
    雪球·财经有深度 by 雪球

    雪球·财经有深度

    21 Listeners

    疯投圈 by 黄海、Rio

    疯投圈

    106 Listeners

    声东击西 by ETW Studio

    声东击西

    278 Listeners

    忽左忽右 by JustPod

    忽左忽右

    447 Listeners

    反潮流俱乐部 by 声动活泼

    反潮流俱乐部

    27 Listeners

    硅谷101 by 硅谷101

    硅谷101

    164 Listeners

    硅谷101|中国版 by 泓君Jane

    硅谷101|中国版

    50 Listeners

    泡腾 VC by 声动活泼

    泡腾 VC

    11 Listeners

    商业就是这样 by 商业就是这样

    商业就是这样

    271 Listeners

    36氪·8点1氪 by 36氪音频

    36氪·8点1氪

    14 Listeners

    知行小酒馆 by 有知有行

    知行小酒馆

    296 Listeners

    晚点聊 LateTalk by 晚点 LatePost

    晚点聊 LateTalk

    23 Listeners

    声动早咖啡 by 声动活泼

    声动早咖啡

    223 Listeners

    涨乐早知道 by 涨乐全球通

    涨乐早知道

    5 Listeners

    商业WHY酱 by 声动活泼

    商业WHY酱

    36 Listeners

    起朱楼宴宾客 by 大卫翁

    起朱楼宴宾客

    44 Listeners

    半拿铁 | 商业沉浮录 by 潇磊&刘飞

    半拿铁 | 商业沉浮录

    290 Listeners

    跳进兔子洞 by 声动活泼

    跳进兔子洞

    47 Listeners

    高能量 by 李翔李翔

    高能量

    27 Listeners