腸内細菌相談室

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本日は、腸内環境や腸活を語る上で頻出の、腸内細菌叢の多様性についてお話します。現代社会においても、多様な文化、多様な人種、多様な人々を大切にする、多様性に対しての重要性の認識が高まっています。では、そもそも、多様とはどのような状況を指すのでしょうか。多様性とは一体何なのでしょうか。多様性を何らかの尺度で測れるようにしなければ、多様化したとは厳密には言えません。よって、腸内環境にしろ、地球環境にしろ、多様性そのものを考えることは重要です。

今回のエピソードでは、多様性をどのように定量的に表現するのか、お話していきます。

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今回のエピソードでは、新型コロナウイルス感染症＝COVID-19に感染した後に生じる新型コロナウイルス感染症罹患後症候群(Post-acute  COVID-19 Syndrome:  PACS)と腸内細菌叢についての観察研究です。PACSに罹ったヒトは、呼吸器系、精神神経系、消化器系の症状を訴えます。PACSは、ここ1年で知見が蓄積されてきたといえます。PACSと腸内細菌叢は、どのように関係しているのでしょうか？

今回紹介する研究は、Liu  Q, Mak JWY, Su Q, et al., Gut microbiota dynamics in a prospective  cohort of patients with post-acute COVID-19 syndrome, Gut 2022です。

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今回お届けする内容は、腸内環境に対する素朴にして奥が深い疑問についてお答えしていきます。それはすなわち、何故うんちは出るのでしょうか？どのようにうんちを出したくなるのでしょうか？うんち＝糞便を体外に排出するというのは、人の体内の恒常性を維持するのになくてはならない機能ですが、排出する方法についてはあまり考えたことがない方も多いのではないでしょうか？そんな素朴な疑問に答えていきます。

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今回のエピソードでは、11/8-11/10の3日間に渡って開催されたInternational  Human Microbiome Consortium  2022に参加してきたご報告です！日本語に直すならば、2022年ヒトマイクロバイオーム国際学会です。ここでは、IHMC2022と呼んでいきます。本大会は、2008年から続く世界最大規模のヒト細菌叢を取り扱う学会で、今回も大変盛況でした。学会ってどんなところなのか、何をするのか、どのように申し込むのか、どのようなことを知ることができるのか、このあたりについてお話していければと思います。

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腸内環境を理解するために必要な生物学の基礎知識をお届けする本シリーズも、最終回を迎えました。今回は、本シリーズ全13回の放送の総集編ということで、今までお話してきた内容を振り返ることで、有機的にエピソード同士の内容が繋がった使える知識として、皆様の中に届けば良いなと思っています。それでは、最後の旅に出発しましょう！

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今回は、腸内環境を理解するために必要な生物学の知識を学ぶシリーズの第13回目ということで、ゲノム、メタゲノムに引き続くゲノム、MAGについてのお話をします。MAGはMetagenome  Assembled  Genomeの頭文字を取った単語で、計算機の支えにより得られるようになったゲノムです。MAGとは何か、MAGは腸内環境を考える上で何故重要なのか、この点についてお話をしていきます！

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本日お届けする内容は、前回に引き続き腸内環境を理解するために必要な生物学シリーズです。前回までに、ヒトゲノム計画に続いて技術革新が続いた生物学の分野にて次世代シーケンサーが登場してから、様々なサンプルに含まれるDNAの塩基配列が、比較的安価にシーケンシングできるようになってきた、というお話をしてきました。今回お届けするのは、次世代シーケンサーによって可能になった、全く新しい解析技術であるメタゲノム解析についてお届けします。まずは、メタゲノムとは何なのか？ゲノムとは何が異なるのかお話していきます！

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腸内環境を理解するために必要な、生物学的な基礎知識から応用までをお届けする本シリーズ。前回までに、サンガー法の応用例としてのヒトゲノム計画や、そこで繰り広げられた研究コンソーシアムと民間企業のセレラ社のドラマについてお話しました。今回は、ヒトゲノム計画以後にバイオインフォマティクスの分野が盛り上がるきっかけとなった次世代シーケンサーについてのお話をします。

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本日は、腸内環境を理解する生物学の基礎シリーズをお休みして、日本で始まった大規模な腸内環境調査プロジェクトのお話をします！このプロジェクトでは、無料であなたの腸内環境を調べることができるので、興味のある方は、是非最後まで御覧ください！そして、参加してみて下さい！

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腸内環境を理解するために必要な生物学の素養を身につける本シリーズ。ついに2桁の大台、第10回目のエピソードに突入です。前回までに、遺伝情報の本質である塩基配列を解読する技術として、サンガー法のお話をしてきました。今回は、サンガー法の技術を応用して、ヒトのゲノムを読むという試み、ヒトゲノム計画についてお話します。

サンガー法では、数百から1000塩基対の配列決定を行うのに対して、今回塩基配列の解読対象となるヒトゲノムは、30億塩基対です。途方も無い遺伝情報の解読作業に取り組んだ人たちの物語をお楽しみ下さい！

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