NeuroRadio

By NeuroRadioScience Life Sciences

NeuroRadio episodes

April 15, 2023#55 And Your Mouse Can Sing
NYUでResearch Associate, 秋から米国PhDコースの藤島悠貴さん(@yfujishima_) がゲスト。RA応募時のこと、現在行っているSinging Mouseの研究、PhDアプリケーション全敗から２年間のRAを経てオファー大量獲得へと至った経緯、思考プロセス、得たノウハウ等を伺いました (4/5収録)
Show Notes:
藤島さんHP

PhDアプリケーションについてのブログ記事 by 藤島さん

RAアプリケーションのブログ記事 by 藤島さん

Michael Longラボ

Darcy Kellyラボ

NYUのRAプログラム

Max Planck FloridaのRAプログラム

Kevin Spencer

Joseph LeDouxの本, 例えばThe Emotioal Brain

GREいらなくね？の記事

Alston’s Singing Mouse (Scotinomys teguina) の解説

Michale Fee ラボ

2019年に出た始めてのSinging Mouse論文 (pdf)

UT AustinのSteven Phelps

鳥の歌学習過程における神経シークエンス変化を追った論文

Deer mice の歌についての論文

ダウンスイープで歌う…の動画

表紙になってた

去年の一月に出た、人間の会話メカニズムについての論文

MikeはZebra FinchのMotor Productionに興味がある: Publication listはこちら

OMC V5 における歌表象プレプリント (収録の時言葉足らずになってしまいましたが、songの一つ一つのnoteに併せてmodulateされてるunitはほとんどなく(一部あるのはsensory feedbackぽい)、songの長さで調整してみてやるとtrialごとに揃っていることから(それぞれのunitのfiring patternは多様(Fig.4))、noteではなくてsong全体を操っているのではないかということで、そういうmodelingをすると、2019年論文でやったcoolingでの結果も併せてpredictできたよということでした。coolingで脳活動を遅くしてあげると、曲の長さが伸びますが、そのときnoteの長さが伸びるのではなくて、曲の伸びた分より多くのnoteで埋められます by 藤島さん)

Arkarup Banerjee lab at CSHL

Dmitriy Aronov の論文

Dmitriy Aronov lab

Buzsaki lab

DmitriyのCaching論文, 例えばこれ

Andreas Bendensky lab

Hopi Hoekstra lab

Betta Fish の仕事、例えばコレ

New York, New York

SoP (Statement of Purpose): アプリケーションの時に使うエッセイのこと

Bence Ölveczky lab

Richard Axel

Vikram Gadagkar lab

Jesse Goldberg lab

Charles Zuker lab

Zuckerman Institute

Center for Theoretical Neuroscience

Larry Abbott

Ken Miller

Jonathan Pillow lab

Alex Willams lab

Eve Marder lab

Surya Ganguli lab

Scott Lindaman lab

Margot Elmaleh

MargotによるRAシリコンプローブ記録の仕事

Liam Paninski

Katherine Nagel lab

Eero Simoncelli lab

Annegret Falkner lab

Dayu Lin lab

Illana Witten lab

Mala Murphy lab

UCLの研究に特化したMaster Course (MRes)

Marc Howard

COSYNE2023

WES (World Education Services) によるGPA変換

Havard のGPA推移

Dukeによる受かったヒトGPA平均の公開

マーク小西 Obituary

Fernando Nottebohm lab

Allison Doupe

Michael Brainard

YusteラボでのDmitriyとJesseのコラボ論文

Neural Mechanism of Acoustic Communication の Gordon Conference

Yuki Haba さん

Princeton学生によるアプリケーション添削

NYU学生によるアプリケーション添削

XPLANE

UJA（海外日本人研究者ネットワーク）

の早野さん

UJA海外留学支援制度データベース

福留さん

XPLANEさんのPhD奨学金リスト

Richard (Dick) Tsien lab

HarvardのResearch Associateプログラム、PiNBAC

Eric Kandel, MD

Richard Axel のエピソード（ノーベル賞のbiographical） “I was allowed to graduate medical school early with an M.D. if I promised never to practice medicine on live patients”

安部公房、人間の妊娠期間エピソードの真相（象…？）

砂の女

Torsten Wiesel, MD

Thomasさん@Buzsakiラボメンバー

African Nile Ratsの生態など

TingleyさんによるGlucose Level とHippocampal SPW-Rs論文

Flatiron Institute

Bob Datta のツール、例えばコレ

NY家探しブログ記事
Editorial Notes:
憧れのお二人とお話できるとのことで舞い上がってペラペラと話してしまいました。この数ヶ月間すごい研究者たちと沢山会って自分もすごくなった気がして調子乗ってましたが、夏からはペーペーの1年生ですので、気を改めてエンジョイしつつがんばりたいと思います。NYCに遊びに来られる際はお声がけください。（僕が最初に読んだLeDoux先生の本はAnxiousでした。パニック発作持ちだったので。）（藤島）

そういえば、九大医3年生の時に当時神経解剖学教室・小坂研にいた福田孝一先生（現・熊大医）からLeDouxのSynpticSelfを借りパクしたのがAmygdala-fear systemとの出会いでした。去年(10年以上経ってから)お詫びのメールを送ったら「そのまま持ってていいよ」とのことだったので、この場を借りて感謝です。「まずはカンデル本通読して・ニューロルシダで形態トレース、話はそれから」とか言われたのでその後解剖に寄り付かなくなって生理に行ったわけですが...。(萩原)

これ学部時代に聴いてたら米国RAに飛び出していたかもな～と思いました（脇）
3 hr 19 min
March 08, 2023#54 It takes two
納税フラグ回収、同僚とのバックカントリー、Ben Barres自伝、フリーアドレスについて雑談。論文紹介は、学習時の場所表象変化、Disynaptic specificity、ConVERGD、非モデル生物Caイメージング、発達期の心臓の相転移、など (2/25収録)
Show Notes:
AIBSのイメージングディレクター、Jack Waters

Kaspar Podgorski

iGluSnFr3

カスパーのブログ

滑落はニュースにもなってる

友人の友人が紹介してたブログ記事

１報目：The formation of an expanding memory representation in the hippocampus

Adam CohenのところでAll-optical physiology

２報目：Disynaptic specificity of serial information flow for conditioned fear

Stuberとか

Kay Tyeがやり始めた”projection target specificity”の流れ

萩原さんによるTweetrial

MiyamichiさんがLuoラボで立ち上げてたTRIO

2015年(?)のPAG論文 (すんません2016年です)

CeAのCRF/SSTのFlight/Freezing論文 (すんません2017年です)

David Andersonラボと出したPKC-δ論文

CAR論文

CAVとHSVを混ぜた系。なんか片方だとpreの細胞の場所が偏るとかよくわからないトロピズムがあって混ぜたということらしいです。

Nikolas Karalis

米原さんのGCaMP6sの初出

３報目：A Novel Single Vector Intersectional AAV Strategy for Interrogating Cellular Diversity and Brain Function

AllenによるLCのin vivoキャラクタライゼーションpreprint

波形で２種類あるのは分かっていた

４報目：Cortical activity emerges in region-specific patterns during early brain development

in pouch エレポはメソッド論文が先に出ていた

５報目：Functional organization of visual responses in the octopus optic lobe

ブタ2P論文

６報目：A bioelectrical phase transition patterns the first beats of a vertebrate heart

イジケビッチ本：Dynamical Systems in Neuroscience (PDF)
Editorial Notes:
どうも最近記憶してるreferenceの年が1-2年ズレる。単に歳なのか、paperpileが便利すぎて文献整理に記憶を必要としなくなっているからなのか(萩原)

イカ養殖手法開発がBSIディレクター就任に繋がるとは(脇)
3 hr 1 min
February 25, 2023#53 Understanding by creating is all you need
シンガポール、南洋理工大学の牧野さん(@Hiroshi_Makino_)がゲスト。UCSD交換留学、CSHLでのPhD時代とUCSDでのポスドク時代、シンガポールの研究環境、独立後に行っているAIと脳の表象比較研究について伺いました（2/14収録）
Show Notes
牧野ラボ

(Fred) Gage ラボ＠Salk

Rusty: Fred Gageのこと

田代ラボ

Roberto Malinowラボ

Krishna Shenoy

PhD時代の仕事１

PhD時代の仕事２

Komiyamaラボ

Yang Danラボ

小宮山さんラボでの１報目

Top-downコントロール from Yang Danラボ

小宮山さんが始めたAwakeでの記録

小宮山さんのとこでの２報目の仕事

Chris Niellラボ

が始めた仕事

DeepMindが出したDQN論文

Demis Hassabis

UC Berkeley のコース

YouTubeで見れる

単著論文（直近の方）

前の論文（独立後一報め）

人間でDQNとfMRIのシグナルを比べた論文＠Neuron

Soft Actor Critic

A2CとPPO

Softmax解説

Temperature解説

強化学習におけるランダムネスの導入方法についての解説（ε-greedy, SARSA, Q-learning）

Sutton & Barto本

Transformer 論文

30分で完全理解するTransformerの世界

Transformerの表現学習と海馬における外界表象を比較した論文

Timothy Behrens

マーの三段階：Marr, D. (1982). Vision: A computational approach.

日本語解説
Editorial Notes
収録ではこちらもいろいろ学ぶこともあり、こういう機会を設けていただいた二人にはとても感謝しています。優秀な人達と議論するのは楽しいことだと改めて思いました。拙い日本語の説明で申し訳ありませんが、なんとなくでも自分達が目指している方向性などが共有できたのであれば幸いです。日本の大学や研究所ともっと連携していけたらと思っているので、気軽にメッセージ下さい。大学生や大学院生も大歓迎です。（牧野）

(リスクとって)新しいことをやり続けて行きたいなー、もっと勉強せんとなーと思わされる収録でした。最近はexploitationの比重が高くなってしまっていてよくないっす。
ゴルフ、ちなみにベストはパープレイ(72)で、シングル手前まで行きました。（萩原）

AI研究の主体は大学院生だから…のくだりに励まされました（宮脇）
2 hr 51 min
January 25, 2023#52 My Favorite Things
新年のんびり雑談回。一時帰国の時に行きたい店、アメリカ来てから買ってよかったもの紹介、グリーンカード申請の様子、タックスリターンの混乱など。(1/20収録)
Show Notes:
Rebuildの缶の音の回 (引き続きここで詳細が議論されている笑)

ルスツ学会

Francesco Ferraguti Lab

Csicsvari オーストリアだけどクロスターノイブルクでした

雪崩講習会(日本雪崩捜索救助協議会)

えびそば一幻

北菓楼【きたかろう】

だし茶漬けえん成田店 (臨時休業中)

ミンガスコーヒー (札幌・大通り) 混んでる時は6Fにある系列店のローチロースターに行くといいです。なぜか混んでなく、こちらは豆売りもしてる

La Cuisine de KAWAMURA (旧グリル・カワムラ) (福岡・薬院) 季節ごとにメニューが変わるので福岡に住んでたら年4回行きたいお店。基本なんでも大変美味しく、冬の厚岸の牡蠣、夏にデザートで出る桃とクローブのスープ等、忘れられない皿が幾つも。スペシャリテの山芋フォアグラ・マデイラソースも絶品なので是非

田奈部にしん蕎麦と焼き味噌をよく頂きました

釜竹うどん、酒肴、日本酒ぜんぶ美味しい

旧こくわがた鶏天HG

臥龍肉麺が好物ですが鶏だけの麺も美味しい

Athletic Brewing 定番ラインでおすすめはRun Wild、スッキリ系IPA。ご飯食べてる時はUpside Downが合わせやすくてよいです

Trillium Brewing ボストンの道の名前がついてるIPAがオススメ

Tree House Brewing Julius, Green, Hazeなど

ノンアルビールレビューのnote

BNSのプロテインバー Amazonで3ヶ月毎に定期購入してます

Instant Pot

Instant Vortex

Polartec図鑑アークテリクスのカイアナイトを一番よく着てます

Futurelight Goldwin製のFL Drizzleを着てます

Goretex vs Futurelightの比較実験動画

Goretex + ダウン

ニトリのカル:エクレの丼

Mastering the American Accent

ニトリのセラミックコートタンブラーただし食洗機不可。その点、京セラのCERAMUGが上位互換そうなので次はそちらを狙ってます。

Weee!

風呂のふた

Tuft and Needle のマットレス 1000ドルじゃなくて750ドルでした笑

つかった移民弁護士

グリーンカード申請の流れ
Editorial Notes:
アフィリエイトとかやっちゃうと収入発生しちゃってTRがより面倒になるんでは...というのが懸念。。。アルコール(特にワイン)はスイス時代に比べると全然飲まなくなったのですが、OR・WAのピノ探索はいずれしたいなと思ってます萩

海外生活便利アイテムある方ぜひ教えてください！脇
2 hr 25 min
January 17, 2023#51 A precise tagging of active neurons
Hyungbae Kwonラボの長濱健一郎さん(@k_hammer_1001)ゲスト回。初期研修から基礎研究に進んだ経緯、狩野研でのスライスパッチャー生活、Hyungbae Kwonラボの現在の方向性、最近のST Cal-Light論文（光受容とCa2+活動による細胞の遺伝学的ラベリング手法のアップデート版）について伺いました。
Show Notes:
長濱さん

最近のST-Cal Light論文

光とCaのアンドゲートロジックによるラベリングその１Cal-Light from Kwonラボ

その２ FLARE from Alice Tingラボ

Hyungbae KwonラボHP

狩野ラボHP

この論文＝狩野研時代のSetd1a論文（注：収録時にはmentionできなかったのですが、ChIP-seqの実験・解析、RNA-seqの解析では東大薬・分子生物学・後藤研にいらした岸先生（岸雄介 (Yusuke Kishi) - マイポータル - researchmap）に大変お世話になりました。あと、ChR2-tdTomato→ChR2-mOrangeでした。by 長濱さん）

上阪さんのretrograde semaphorinのScience論文

ニューロランチ：東大医学部の神経系のラボが集まって、金曜日の昼飯時に行う背筋も凍りつくような名物セミナー

2016年のSingh et al.,論文

2014年の高田さんの論文

高田ラボ

Maria Karayiorgou

Joseph Gogos

CompetitorのSetd1a論文

iTango論文

Alice Tingラボ

オーフスの米原さんラボ（遺伝研に移行中）

Jung Ho Hyun

Dongmin Leeラボ（注：”Nat. Biotechnol.のCal-Light論文でvalidationを全部行った”と行ってしまったのですが、正しいcontributionはCal-Lightの設計・in vitroのvalidsation→Dongmin、in vivoのvalidation→Jung Hoでした。by 長濱さん）

Guopingが使った例

Josh Gordonが使った例

Matthew LarkumがCAMPARIと比較したFrontier論文

Tina Kim

FLiCRE（フリッカー）論文

SoCoChR論文

StCoChR論文についてのOferと萩原の見解

LiqunのところのTRAP その２

CAMPARI

CAMPARI2

rsCAMPARI

Photoactivatable Cre 例えばコレ
Editorial Notes:
いちリスナーの自分がまさかゲスト出演することになるとは思っていませんでした。お二人との議論とっても楽しかったです！色々とbackgroundの前置きが長くなってしまいましたが、これから海外でポスドクしようとしている大学院生やポスドクの方に、こんな人もいるんだなぁ、と思って頂けるといいなと思います。またメインプロジェクトの論文出たら、ぜひ呼んでください！（長濱）

最初期遺伝子では神経活動を捉えられない、という見方と、遺伝子発現変化に繋がらない神経活動はエングラムではない、という立場があるのかな…何がノイズで何がシグナルなのか、とかの検証が色々できそう（宮脇）

出だしの導入で記録と操作が...とか言って始めていますが、「おい、(形態)観察は？」というツッコミが解剖寄りの人から来るのは想定済みです汗 (萩原)
2 hr 57 min
December 02, 2022#50 Gestalt principles
久々のSfN参加、初Thanksgiving、Twitterからの移行に関する雑談。論文紹介は、カリウム選択的チャネルロドプシンの構造、魚の脳発達は氏か育ちか、プルダウンアッセイと機械学習によるAAVの指向進化、など (11/26収録)
Show Notes:
萩氏のアブストラクト

Jeremiah

Joshua Trachtenberg

古館昌平氏

ヨーロッパは運転免許証のExpireが無い：国によって違うらしい。スイスは無い、ドイツは10-15年？

GRABでペプチドのセンサー

Rebuildのエピソード

Twitter上での繋がりを保存するツール
フラッシュ論文
論文１：Structural basis for ion selectivity in potassium-selective channelrhodopsins

加藤英明さんラボ

出てもらった時のエピソード

HcKCRを最初に報告した論文

WiChRプレプリント（Sci. Adv. in press）

ChRmineの論文

加藤さんのNat Comm

論文２：Nature over Nurture: Functional neuronal circuits emerge in the absence of developmental activity

Florian Engertラボ

Dániel Barabási

目を閉じたらVisual Cortexの発達おかしくなる、の論文

Tom SudofのVerhage et al Science 2000

Sando et al., 2017 Neuron

バラバシさんのツイート

Herwig Baier

のツイート

フロリアンのかなり長いスレッド

Ken Miller

の参戦

Blake Richards

の参戦

David Fitzpatrickラボ

苦情

論文３：Targeting AAV vectors to the CNS via de novo engineered capsid-receptor interactions

Ben Deverman lab

CREATEの論文

ExtinctionのF1アッセイ

Gradinaruのラボから、マカクで通るかもね、のプレプリント

北海道はルスツでスキーをしようの学会
Editorial Notes:
バラバシって今の大学院生にも人気なんでしょうか（脇）

ExtinctionのF1(2)の仕事、メインコラボレータの仕事なのに完全に失念してた...（萩）
2 hr 21 min
October 24, 2022#49 Memento Mori
ゲスト回ラッシュの振り返り、感染フラグ、前向性健忘に関する雑談。フラッシュ論文紹介は、皮質と海馬のタスクルール表象の違い、内在mRNA依存的な外来mRNA翻訳制御法、方位選択性コラムの起源示唆、マイクログリア用AAV、実験メタデータ管理、１分子プロテインシーケンシング、等(10/15収録)
Show Notes:
Eve Marderの新作 The Complement Sandwich

感染した場合は180日後くらいの方が抗体価上がる

ASCONA meeting

アメリカ政権のオープンアクセスMandatory

AAASのプレプリントに対するポリシー

DIANA論文

Abema Primeのひろゆき全推し回、YouTube

Mさん（Henry Molaison）について、ラリースクアイアによる追悼記事

Henry Molaisonは海馬じゃなくてエントライナルが飛んでた

メメント

論文１・Samborska et al., Complementary task representations in hippocampus and prefrontal cortex for generalizing the structure of problems

論文２・CellREADR論文：Programmable RNA sensing for cell monitoring and manipulation

内在性ADARの発現：HEKは1を多く発現して2,3を発現しないらしい。組織ごとにEditを受ける場所が違うんだとか。

ペーボ取りましたね、ノーベル賞

RADAR論文(RNA sensors using ADAR)：Modular, programmable RNA sensing using ADAR editing in living cells

RADARS論文(Reprogrammable ADAR Sensors)：Programmable eukaryotic protein expression with RNA sensors

論文３・Orientation pinwheels in primary visual cortex of a highly visual marsupial

数年前に書いたレビュー

論文４・Directed evolution of adeno-associated virus for efficient gene delivery to microglia

Addgeneでカプシドをコードしているプラスミドが入手可能

論文５・Next-generation brain observatories

Observatory of the mind

Saskia de Vries et al.

Joshua H. Siegle et al.

Neural Data Without Borders

Mindscope

論文６・Real-time dynamic single-molecule protein sequencing on an integrated semiconductor device

DNAとヘリケースを使ってre-readしてfidelityを上げる
Editorial notes:
CellREADR/RADAR/RADARS、延びる棒、のアイデアがラボ間でどうshareされていったのか（あるいはされていないのか）、ご存知の方はコッソリ教えてください笑（脇）

収録中に論文のタイトルコールしてないの不親切で悪い癖ですね...以後気をつけます。(萩)
3 hr 3 min
October 17, 2022#48 In search of thalamo-cortical computational principles
We sat down with Lukas Ian Schmitt (@lucidianS), a team leader at RIKEN CBS, and talked about his trajectory, life in Japan, past and ongoing projects about the distributed computation in the cortico-thalamic loop, and related works (Recorded on 9/10)
Show Notes:
Ian’s lab at RIKEN: Laboratory for Distributed Cognitive Processing

Miho: Miho Nakajima-san

Mike Halassa’s lab @NYU->MIT

Phil Haydon’s lab @Tufts

The Neuron by Kaczmarek (and Levitan) (Still have the original on my shelf here. – Ian)

Ian’s work at the grad school: the astrocyte-neuron interaction

Ian’s works during postdoc: Rule representations in the cross-modal sensory attention task #1 #2 (mentioned as ”The thalamo-cortical paper”, MD-mPFC loop) #3

Guo/Inagaki’s paper (VM/VAL-ALM loop)

If you change the rule sets, the dynamics change a little bit in subgroups of MD thalamic neurons

A review discussing the region identified as the PPC - Ian

Ian’s strategy for the research

Ahena Akrami’s paper

Jeremiah Cohen

His recent publication on representation of the task history in PL

Computational Advantages conferred by biologically inspired networks

Structured networks sometimes perform better/faster

Idea of having a parallel stream of processing through the thalamus is useful: I was thinking of some ideas from Murray Sherman and Sabine Kastner (e.g. this paper, and this) – Ian
Editorial Notes:
Really nice conversation though I guess we have some difference as to whether thalamic computational roles are an inevitable network design or just based on evolutionary history (I guess time and research will reveal who's right!) In any case, I really enjoyed talking science with you both! - Ian

I enjoyed the discussion and it was nice to see the connection between Ian's work and others' on the thalamus. It seems the time has finally come to decipher thalamic functions and I hope our new work will change the way we think about how the brain computes information!　-Miho

Recent evolutionary expansion in thalamus/LP could be just optimization around local minima. Let’s see how Ian’s work would discard this possibility! For now, we can happily agree to disagree! - Kenta/萩

It was a perfect way to drop our first episode for both domestic and international listeners. Thanks, Ian and Miho! -Tak/脇
1 hr 32 min
October 10, 2022#47 On flexibility in cognitive processes, behavioral paradigms, and careers
理研CBSの中島美保さん（@mihonakajima）がゲスト。大学院時代とポスドク時代の仕事の背景、それらを踏まえたCell Typeに関する議論、特定の高次機能を問うためのTailor-made行動試験の作り方、などを伺いました (8/17, 9/10 収録)
Show Notes:
認知分散処理研究チームHP

中島さん業績集

Nat Heintzラボ

オキシトシンに反応するmPFCニューロンのメス性行動への影響…のお仕事

BAC Tgの基礎を作ったHeintzたちの仕事 in 1997

BAC トランスジェニックの神経科学への応用を解説した2001年のレビュー

Michael Halassaラボ

Halassaラボでの注意機能による感覚選択を司る脳回路、のお仕事

その自閉症モデルでの状態と緩和方法探索、のお仕事

イアン・シュミット

GENSATの論文

TRAP ：ここではTranslating Ribosome Affinity Purification (TRAP) のこと。その１その２

Parafascicular nucleus: 束傍核。Striatumによく投射する

TRN: Thalamic Reticular Nucleus 皮質とThalamusを繋ぐ抑制性ニューロンの核。最近印象的だったGuoping Fenの仕事とか

マット：Matt Wilson

State-dependentなTRNの論文

イアンが最初に立ち上げた行動

中島さんが神経回路学会に載せていた行動実験に関する日本語レビュー

Earl Millerラボ

MD（mediodorsal thalamus）の仕事

b2bになっている Guo/Inagakiの仕事 (ALMに対応するthalamusは”VM/VAL”)

Pulvinar視床枕。ヒトでの機能的な示唆については、これとか

Guoping Feng

2016年のプロジェクト

PPC：posterior parietal cortex

NeuroRadioのCell Type 回

KarelとSvobodaとCallawayのレビュー

Hongkuiのレビュー
Editorial Notes:
今回は貴重な機会を頂きありがとうございました！本当に長々と申し訳ないです。お二人とも話が非常に明快で一瞬で重要なポイントをついてくるので、勉強になりました。これからの更なるご活躍が楽しみです！私は日本語も英語も結構間違えてて反省！（汗）エレベーターピッチの練習しないと。これからも人間の行動に迫っていきたい思うので乞うご期待！（中島）

ブザキとかは心理学で先に定義された用語に神経活動を後から対応付けることに否定的な主張をしていますが（それも一理あるとは思いますが）、今回の話を聞いて、やっぱ行動心理学をちゃんと勉強した方が色々とやりようがありそうだよな～、と思いました（脇）

常々、研究者として一番大事な能力の一つはresilienceだと思っていますが、度々苦境に立たされつつも、その度にいい仕事をいい論文に仕上げてくるスタイルに大変刺激を受けます！（萩）
2 hr 48 min
October 07, 2022#46 The Fos expression we saw that day
ゲスト参加型のJournal Club。海馬CA1ニューロンにおけるFos発現と場所表象・神経活動の双方的な関係を調べた論文を題材に、北西卓磨さん(@tkitanishi)、吉良信一郎さん(@ShinichiroKira)、田中和正さん(@Kazu_ZT)、柳下祥さん(@sho_yagishita) とディスカッションをしました。(9/22 収録)
Show Notes(完全版):
お題の論文：Fos ensembles encode and shape stable spatial maps in the hippocampus

田中さん

NR田中さん回

北西さん

NR北西さん回 Part1 Part2

柳下さん

吉良さん

Harveyラボ

Greenbergラボ

田中さんのトムラボでの論文

Thomas McHugh

よく使われるcFos-tTA, Mayfordの作ったライン *knock-inと言ってますがtgです(萩)

の元論文

最初の利根川研での仕事 Fig1fgでshGFPがまあまあ綺麗に見えている

田中さんのWiltgen研での仕事

Georg KellerのbioRxiv論文 (Mahringer 2019)

Rewardの所に場所細胞が増える

海馬の一部の細胞でreward response, David Tank のDedicated Population for Reward論文

以前Greenberg達が作ったFosのトリプルノックアウトの系

1st authorが書いたbehavioural engagementに関する前の仕事

FamiliarなEnvironmentだとFosはほぼ出ない、の論文

最近Twitter界隈ではCausalityに関する議論がある：いろんなスレッドがありましたが、この(Tweetに基づく)PDFが一番核心を突いていたように思います。 by 吉良さん

アテンションを高めて空間タスクをやらせると安定性up

Schitzerがendoscopeで見始めた時

学生たちと一緒に書いたCurrent Opinionの総説
Editorial Notes:
JCでこんなに論文ほじくり返したのは久しぶりです！マニアックなディスカッションもあって、とっても濃い2時間でした。またぜひ呼んでください！次は辛口ゲストを集めてNR主催のお二人の論文とかどうですかね？（笑）(田中)

濃くて楽しいJCでした！それぞれのラボのスタイルが垣間見えるのも面白いですね。(北西)

海馬やfosを専門にやっている方々と議論できてよかったです。ぜひ定期的にやって欲しいです。今回のような分野横断的で新しい方向性の論文だと特に盛り上がりそうです。他の方々の議論を聞くのも面白そう(柳下)

普段あまり接することのない、分子と神経活動の関係を扱う論文について議論する機会をいただき、とても勉強になりました。図表のフェアな作成法や因果性の解釈についても、様々なご意見を伺うことができて充実したJCでした。(吉良)

音声での論文紹介をはじめた当初から、正直どのくらい伝わるんだろうか...と思いながらやってますが、最近では自分達が楽しめてその雰囲気が伝われば、ドメイン知識自体は別にどうでもいいかなと開き直っています。メンバーを変えつつ定期的にやれると楽しそうです(萩原)

これだけ大人数のディスカッションなのに議論が発散しなかったことも印象的でした。皆さんお忙しい中ご都合つけてくださりありがとうございました！ (宮脇)
2 hr 38 min